Scholengemeenschap Spectrum wordt bestuurd door een beheerscomité, dat bestaat uit de schepenen van de gemeenten Jette, Koekelberg, Sint-Agatha-Berchem en Vorst, die bevoegd zijn voor het Nederlandstalig basisonderwijs. Ze worden bijgestaan door de ambtenaren van de gemeenten, die de diensten van het Nederlandstalig onderwijs leiden. De directeur-coördinator zetelt als secretaris met raadgevende stem.
Het beheerscomité wordt geadviseerd door de directieraad, die de beleidsstrategie en -voorstellen voorbereidt, de opdrachten van het beheerscomité uitvoert en de dagelijkse leiding van de scholengemeenschap in handen heeft.
